Synthèse de peptides antimicrobien actif contre Streptococcus mutans : intégration de la conception assistée par IA

Développement assisté par IA de nouveaux peptides antimicrobiens ultra-courts pour lutter contre l’antibiorésistance observée dans le cadre de pathologies bucco-dentaires et étude des mécanismes d’action.

Coordination :

• Émilie Genin, professeure à l'université de Bordeaux - Institut des sciences moléculaires (ISM)
  Département Sciences de la matière et du rayonnement (SMR)
• Akka Zemmari, professeur à l'université de Bordeaux - Laboratoire bordelais de recherche en informatique (LABRI)
  Département Sciences de l’ingénierie et du numérique (SIN)
• Johan Samot, maître de conférences et praticien hospitalier (MCU-PH) à l'université et au CHU de Bordeaux - laboratoire d’œnologie (OENO)
  Département Sciences de l’environnement

Des plantes aux os : exploitation de la métabolomique dans une approche multi-proxie des régimes alimentaires actuels et passés

Vers des reconstructions de régime alimentaire des mammifères plus précises à partir des restes squelettiques.

• Antoine Souron, maître de conférences à l'université de Bordeaux - laboratoire de la Préhistoire à l’actuel : culture, environnement et anthropologie (PACEA)
  Département Sciences archéologiques
• Pierre Pétriacq, maître de conférences à l'université de Bordeaux - laboratoire Biologie du fruit et pathogénicité (BFP)
  Département Sciences de l’environnement

Exposition au gadolinium : menaces sanitaires, environnementales et sociétales

La présence croissante d’agents de contraste à base de gadolinium (Gd-CAs) dans les écosystèmes aquatiques et les eaux potables entraine des enjeux environnementaux et sanitaires majeurs. Le projet ONE HEALTH propose d’y répondre en définissant les effets (éco-)toxicologiques et les risques liés à une exposition croissante des écosystèmes aquatiques et de l’Homme à ces contaminants émergents. Pour cela, quatre axes complémentaires et exploratoires permettront d’évaluer : les effets écotoxicologiques d’une exposition chronique aux Gd-CAs chez les jeunes stades de vie de poissons ; les effets toxicologiques d’une exposition chronique aux Gd-CAs chez la souris en gestation et sa progéniture ;  les risques sanitaires et environnementaux associés et comment le droit et les politiques publiques traitent ou devraient traiter la question de ces contaminants émergents, conformément au droit fondamental à un environnement sain et dans des approches couplées des concepts « Exposome » et « One Health ».
 

• Clément Pereto, ingénieur de recherche à l'université de Bordeaux - laboratoire Environnements et paléoenvironnements océaniques et continentaux (EPOC)
  Département Sciences de l’environnement
• Magalie Baudrimont, professeure à l'université de Bordeaux - laboratoire Environnements et paléoenvironnements océaniques et continentaux (EPOC)
  Département Sciences de l’environnement
• Didier Morin, professeur à l'université de Bordeaux -  Institut de neurosciences cognitives et intégratives d’Aquitaine (INCIA)
  Bordeaux Neurocampus
• Marion Tissier-Raffin, maîtresse de conférences à l'université de Bordeaux - Centre de recherches et de documentation européennes et internationales (CRDEI)
  Département Droit et transformations sociales (DETS)

L’objectif du projet PaléoPépins est de lever les verrous scientifiques liés à l'analyse de vestiges archéobotaniques pour retracer l'origine et l'évolution de l'encépagement de la région bordelaise. Il ambitionne de développer des méthodologies innovantes en morphométrie, (paléo)génomique et théorie des graphes afin de mieux comprendre l'histoire de la viticulture et des pratiques culturales de la région.

• Pierre-François Bert, maître de conférences à l'université de Bordeaux -laboratoire Écophysiologie et génomique fonctionnelle de la vigne (EGFV). Département Sciences de l'environnement
• Fanny Mendisco, ingénieure de recherche CNRS - laboratoire de la Préhistoire à l’actuel : culture, environnement et anthropologie (PACEA)
  Département Sciences archéologiques

Description : Effet de perturbateur endocrinien potentiel et avéré sur l’holobionte de la truite arc-en-ciel à un stade précoce en caractérisant l’ontogénèse du microbiote et la dynamique des métabolites avec des approches omiques complémentaires

Coordination :

• Laure Bellec, maître de conférences - laboratoire Environnements et paléoenvironnements océaniques et continentaux (EPOC, unité Bordeaux INP, CNRS et université de Bordeaux)
  Département Sciences de l’environnement
• Nicolas Creusot, chargé de recherche INRAE – unité Écosystèmes aquatiques et changements globaux (EABX, unité INRAE)
  Département Sciences de l’environnement
• Hélène Budzinski, directrice de recherche CNRS - laboratoire Environnements et paléoenvironnements océaniques et continentaux (EPOC, unité Bordeaux INP, CNRS et université de Bordeaux)
  Département Sciences de l’environnement

Description : Décryptage des seuils de stress hydrique et des mécanismes associés à la défaillance hydraulique par le couplage de la tomographie microcomputée à rayons X et des nanocapteurs optiques sur plusieurs espèces de cultures et d'arbres

Coordination :

• Sylvain Delzon, Directeur de recherche INRAE – laboratoire Biodiversités, gènes et communautés (BIOGECO, unité INRAE et université de Bordeaux)
  Département Sciences de l’environnement
• Laurent Cognet, directeur de recherche CNRS - Laboratoire photonique, numérique et nanosciences (LP2N, unité CNRS, IOGS et université de Bordeaux
  Département Sciences de la matière et du rayonnement (SMR)

Description : Cette collaboration se donne pour but d’étudier la paléorecharge des aquifères du Bassin nord-aquitain exploités pour l’eau potable et d’en déduire des données paléoclimatiques, grâce à l’analyse d’isotopes à l’échelle de traces (18O, 2H, 14C, gaz rares).

Coordination :

• Michel Franceschi, maître de conférences à Bordeaux INP - laboratoire Environnements et paléoenvironnements océaniques et continentaux (EPOC, unité Bordeaux INP, CNRS et université de Bordeaux)
  Département Sciences de l’environnement
• Denis Horlait, chargé de recherche CNRS - Laboratoire de physique des deux infinis de Bordeaux (LP2IB, unité CNRS et université de Bordeaux)
  Département Sciences de la matière et du rayonnement (SMR)
• Pascal Bertran, ingénieur de recherche INRAP - laboratoire de la Préhistoire à l’actuel : culture, environnement et anthropologie (PACEA, unité ministère de la Culture, CNRS et université de Bordeaux)
  Département Sciences archéologiques

Description : Transition agro-écologique et santé humaine. Stevia rebaudiana est une espèce végétale connue pour accumuler dans ses feuilles des glycosides de stéviol (SG), utilisés comme édulcorant naturel. Une production locale et durable de cette espèce dans le Sud-Ouest de la France a récemment été développée au travers d’une filière complète de la production à la transformation. Cette espèce de diversification pour les agriculteurs, produite en agroécologie, nécessite également, pour la pérennité de sa culture, d’être valorisée sous différentes formes. Or, cette espèce, domestiquée récemment et relativement peu sélectionnée, synthétise outre les SG, des polyphénols, dont les effets anti-inflammatoires et anti-cancéreux/chimio-radio protecteurs n’ont été que partiellement explorés et qui seront évalués dans ce projet.

Coordination :

• Valérie Schurdi-Levraud, professeure d’université - Biologie du fruit et pathogénicité (BFP, unité INRAE et université de Bordeaux)
  Département Sciences de l’environnement
• Sandrine Dabernat, professeure d’université et praticienne hospitalière - Bordeaux institut of oncology (BRIC, unité Inserm et université de Bordeaux)
  Département Sciences biologiques et médicales (SBM)
• Stéphanie Krisa, maîtresse de conférences – laboratoire d’œnologie (ŒNO – unité Bordeaux INP, BSA, Inrae et université de Bordeaux)
  Département Sciences de l’environnement